有机小番茄为喜温蔬菜喜光，光照不足落花落果严重；对水分要求前期少，后期多；对土壤的适应性强，在砂壤土上表现好，喜钾肥，同时为防治脐腐病的发生，应适当施用钙肥。有机小番茄产量相对较低，亩产600-1500公斤，但销售价格较高。主要品种有圣女、玲球、樱桃红等。
栽培季节：有机小番茄栽培季节与普通西红柿相似。露地栽培，春播可在2月份保护地育苗，4月下旬终霜后定植，6月中、下旬进入采收期。秋播可在7月份育苗，8月定植，10月开始采收。保护地栽培可适当提早或延后栽培。
苗床准备：育苗床应选在未种过茄科蔬菜的地块，选肥沃田园上掺入40-50%腐熟有机肥，每方营养土中混入草木灰5-10公斤，混合后过筛，铺干育苗床上。早春育苗苗床要设在温室内，气温太低应铺设电热线；夏季育苗苗床要设在阴凉、通风处。夏天雨水多，育苗床要有避雨设施，床端要有排水沟。
幼苗管理：早春育苗应注意保温，出苗前苗床地温控制在25-30℃。夏季育苗应防雨、降温。当大部分种子出苗后要及时降温，温度控制在白天20℃、晚上12-15℃当幼苗长出两片真叶时分苗。
分苗：早春温度渐高，分苗床一般不用铺地热线。早春分苗应在晴天上午进行，采用暗水栽的方法，先开沟，再浇水，待水渗下后放苗、埋土。埋好后表面看不到泥水。株行距10×10厘米。夏季分苗在傍晚或阴天进行，方法同早春分苗。株行距10×10厘米。栽后灌水，畦上遮阳，待缓苗后去掉覆盖物。分苗床温度在缓苗前白天25-28℃，晚上15-18℃；缓苗后白天20-25℃，晚上13-15℃。早春不浇水，夏天分苗床经常浇水。幼苗长至8片真叶时定植。
定植：先整地，结合深翻每亩施腐熟有机肥5000公斤，平地后做150厘米宽平畦（若早春扣地膜则做高10厘米、畦面宽50-60厘米小高畦）。平畦每畦定植3行，小高畦每畦定植1行。株距20-30厘米，每亩定植4500-6000株。扣地膜的先整畦铺膜，然后按株距打定植穴定植，定植深度以子叶距地面1厘米为度。
田间管理：浇水。浇足定植水的，至穗花序开花坐果不用再浇水。若定植水浇的少，可在畦内开沟浇小水，选晴天上午进行。穗花坐果后浇次大水，结果期需水量大，每5-6天浇一次水，要求见干见湿。来收期减少浇水，以防裂果。整枝。樱桃西红柿植株高大，直立性差，当植株长至50厘米时插架以防倒伏。侧枝生长力强，一般进行双干整枝，先留2个壮枝，其它抹去。一般不打顶，当下部老叶发黄时及时摘掉以减少养分消耗。
采收：完全成熟时采收，采收时要保留萼片和一段果柄。